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=== 与王菲的争论 ===
2011年2月6日20时13分，王菲在微博上转了网友“我执难破”的一条微博，并对微博中的木制佛像在大火中竟然丝毫无恙地屹立在夕阳中表示“无以言表 不可思议 顶礼遍知佛尊~”。经过网友转发，方舟子迅速发表了一条充满火药味儿的评论：“还有无数尊葬身火海的佛像你也别忘了顶礼。谁要觉得这尊佛像不可思议的，拿来点把火试试？”王菲当即不甘示弱，反问方舟子：“你想试什么？能不能点着么？”方舟子应战称：“实验检验传奇。”

7日上午9时49分，王菲再写了一条微博请方舟子“方老师 不要科学地不讲理~ 我们讨论的是木头能否被烧着的事么？事实上我们认为万物都有生灭 就算是真金佛像也有消散的那天 我们相信的是某种内在的力量 这个你不懂 我懂的~ 我们体会的是内因 你注重的是外缘~ 如果真想做这个实验 恐怕也得找个相当大的楼 点一把差不多的火 才是本着科学的严谨态度吧~”。7日15时14分，方舟子不甘示弱，引用王菲的句式写道：“你不要信仰地不讲理。”50分钟后，方舟子再度在微博中称：“谁说宗教信仰能提高人的教养的，到网上看仔细了。”

2011年2月7日19时，王菲发博回应方舟子“能跟你对话就挺不可思议的 不聊了 过年好~”，主动退让意图息事宁人，然而方舟子咄咄逼人，将骂战升级到攻击王菲粉丝，引起网友广泛谴责。

中新网、中国日报等媒体报道：

在百度“王菲大战方舟子”的贴吧中，有网友认为，“王菲怎么看都是在礼让。倒是某博士咄咄逼人，最后还硬要发篇某寺庙大火一切烧尽的微博，姿态太不自信。”网友原配瑞儿则认为：“王菲的行为是一种常人可以理解的行为，一种微妙的习俗和信仰的感情，并不是说发大火时，她就一定会找个佛像躲着。而方舟子却用科学的标准去评断这种感性的行为显然用错了标准。”